이렇게 하면 되지 않을까요?

select item, qty2006, qty2007, qty2006-qty2007 수량차이

from  (select item,

               sum(decode(substr(date,1,4), '2006',qty) qty2006 ,

               sum(decode(substr(date,1,4), '2007',qty) qty2007 

         from invoice

         where date between '20060101'and '20070630'

         group by item

          )

지금은 인덱스를 사용하려고 불필요하게 2006년 7~12월 데이터까지 읽습니다만,

다음과 같이 변경해도 되겠죠.

where (date like '2006%' and substr(date,5,2)) in ('01','02','03','04','05','06')

or date like '2007%' and substr(date,5,2)) in ('01','02','03','04','05','06'))